xenia: (Default)
[personal profile] xenia
Сегодня был чудесный день. Я два раза съездила за едой. Один раз в дорогой и хороший магазин, другой - в попроще и подешевле. Днем мы с Лайзой, которая изучает рнк в Стенфорде, пошли плавать в бассейне. Он огромный, под открытым небом. Мне очень понравилось. Думаю, я буду плавать регулярно.

А вечером я запекала лосося в пармезане и мы с мистером Дэвисом ели его с коричневым рисом и овощным салатом.
Photobucket

Date: 2010-09-13 04:45 am (UTC)
From: [identity profile] polyejika.livejournal.com
Прекрасно!
И да, наконец-то Бархашечка в иноземных интерьерах ;-)
Вы клевые!

Date: 2010-09-13 05:13 am (UTC)
From: [identity profile] lensovet.livejournal.com
кто такой рнк?
бассейн под открытом небом классно, когда погода хорошая. а вот в феврале, когда на улице +10 и льёт дождь, это полное г. так что энджой это дело пока можешь :)

Date: 2010-09-13 05:18 am (UTC)
From: [identity profile] xenia.livejournal.com
я просто буду ходить в бассейн :-)
ribonucleic acid. ты чего, в школе не учился? :-)

Date: 2010-09-13 05:44 am (UTC)
From: [identity profile] lensovet.livejournal.com
а че там изучать? я думал что там уже все решено

Date: 2010-09-13 06:50 am (UTC)
From: [identity profile] nokachi.livejournal.com
они там считают всякую херню, третичную чтоли структуру. Она ж в виде hairpin, а потом ещё сворачивается по-разному при разных температурах и вблизи от кулоновских потенциалов. Вот они это тупо в лоб термодинамикой, dynamic programmingом решают, но вообще-то не очень понятно зачем.

Date: 2010-09-13 07:08 am (UTC)
From: [identity profile] hejjhog.livejournal.com
Для того, чтобы предсказывать возможные ДНК-РНК, РНК-РНК и РНК-белковые взаимодействия.

Сейчас нет 100% адекватного способа математически смоделировать даже вторичную структуру РНК, не говоря уже о третичной.

По поводу того, что вторичная структура РНК = шпилька - это не совсем верно. Любая достаточно протяженная последовательность рибонкулеотидов может образовывать разные комбинации шпилек, петель, узлов (итд, итп), которые потом будут вместе сворачиваться и формировать гораздо более сложные третичные структуры, которые уже будут выполнять определенную функцию. Нокаут-исследования функций РНК не приводят, зачастую, к успеху (потому что РНК может быть в клетке неактивной, или другая РНК может транскрибироваться и замещать ее функцию, или могут нарушаться РНК-РНКовые взаимодействия и запускаться целый каскад последствий). Поэтому одним из наиболее перспективных методов выявления функции РНК, зная ее последовательность - это сопоставление предсказанной вторичной и третичной структуры новой РНК с предсказанной или экспериментально выявленной структурой РНК с известной функцией.

Date: 2010-09-13 07:38 am (UTC)
From: [identity profile] nokachi.livejournal.com
Дашенька, надеюсь, вы решите эту проблему тысячелетия без особого труда.

Date: 2010-09-13 08:20 am (UTC)
From: [identity profile] hejjhog.livejournal.com
Я не computational biologist и интересуюсь этой проблемой исключительно как end user. Мне просто нужно предсказывать структуру РНК, имея на руках их последовательность. Так что за проблему самого моделирования я даже браться не буду =)

:)

Date: 2010-09-13 07:20 am (UTC)
From: [identity profile] hejjhog.livejournal.com
Далеко нет. РНК - одна из "hot topics" современной молекулярной биологии. Относительно недавно были открыты короткие РНК, причем каждый год открывают новые и новые подклассы этих молекул, с разными функциями (да и функцию piРНК мы толком не понимаем, сколько бы статей на эту тему не публиковали).
Еще не очень понятно, какая часть генома транскрибируется (с образованием РНК) и зачем. Какую роль играет транскрипция мобильных элементов? А альтернативный сплайсинг? итд итп

Фишка в том, что с РНК очень сложно работать (в отличие от ДНК и белков), потому что ферменты, разрушающие ее, везде, и очень хорошо и быстро работают. Ну, и долгое время все тоже думали, что с РНК "все просто и понятно".
А потом понаоткрывали. (См. например тут про регуляторные РНК http://en.wikipedia.org/wiki/RNA )

Pacific Salmonidae

Date: 2010-09-13 06:06 am (UTC)
From: [identity profile] alphacentauri1.livejournal.com
Лосось - это хорошо. FYI, может пригодится, таблица соответствия английских и русских названий:

Тихоокеанских лососей (Pacific salmonidae), которые водятся на западном побережье (и у нас на дальнем востоке) и которые продаются в местных магазинах/ресторанах, 5 основных видов:

King/Spring salmon - чавыча (отлично идёт запечённая в итальянском соусе - Italian source, не zesty, а обычный)
Sockeye salmon - нерка (вроде самый дорогой/вкусный лосось, из неё самые простые котлеты по-израильски - просто объеденье, праздничное блюдо)
Coho salmon - кижучь
Chum salmon - кета (из неё, говорят, самая лучшая икра)
Pink salmon - самый распространённый/дешёвый лосось. Хоть и рыба конечно красная, но с вышеуказанными всё же не сравнить.

В любом случае, просто жарить лосося, кроме горбуши, - это надругательство над такой рыбой.

Ещё может быть Rainbow trout/Steelhead salmon - микижа или радужная форель, это уже пресноводный лосось, кому как, но по мне, пахнет обычной "речной" рыбой.

Часто продаётся ещё Atlantic salmon - сёмга или атлантический лосось. Это вообще не тихоокеанский, а "благородный" лосось, с другого побережья, хотя на западе его часто выращивают на фермах (= кормят всякими добавками, частая тема в прессе).

Re: Pacific Salmonidae

Date: 2010-09-13 06:39 am (UTC)
From: [identity profile] alphacentauri1.livejournal.com
Pink salmon - горбуша

Re: Pacific Salmonidae: Russian Link

Date: 2010-09-13 08:11 am (UTC)
From: [identity profile] alphacentauri1.livejournal.com
В продолжение лососевой темы, there's a Russian link here. Официальные латинские названия этих тихоокеанских лососей - русские. Just ouf of curiosity.

Чавыча - Oncorhynchus tshawytscha
Нерка - Oncorhynchus nerka
Кижуч - Oncorhynchus kisutch
Кета - Oncorhynchus keta
Горбуша - Oncorhynchus gorbuscha
Микижа - Oncorhynchus mykiss

Date: 2010-09-13 06:15 am (UTC)
From: [identity profile] andijana.livejournal.com
Бархан обалдевший. )

Date: 2010-09-13 06:30 am (UTC)
From: [identity profile] mithotyanochka.livejournal.com
а я тут подсела на коричневый рис. Дома белый ненавидела, а тут бурый - основная моя еда )))

Date: 2010-09-13 02:30 pm (UTC)
From: [identity profile] saint-dragon.livejournal.com
ой, а как ты его готовишь? Я как-то попробовала и показалось оно мне гадостью. Правда я рис всегда не любила, исключение - жареный рис.

Date: 2010-09-15 01:42 am (UTC)
From: [identity profile] mithotyanochka.livejournal.com
а у меня рисоварочка есть. Правда, н дума, что она готовит как-то по-другому, чем просто кастрюля на плите ))
Я обычно варю рис, перемешиваю с жареным фаршем, или просто как гарнир...

Date: 2010-09-13 06:40 am (UTC)
From: [identity profile] valentyna.livejournal.com
вот теперь вижу собственными глазами, что Барханчика да, тискают и любят всячески! :))

=)))))))))))

Date: 2010-09-13 06:58 am (UTC)
From: [identity profile] hejjhog.livejournal.com
Ой, а можно для посвященных и озабоченных: а чем именно, связанным с РНК, Лайза занимается???
(не знаю, помнишь ты или нет, я же тоже в аспере буду РНК заниматься - нкРНК, РНК редактированием, если вдруг она спросит)

Re: =)))))))))))

Date: 2010-09-13 03:21 pm (UTC)
From: [identity profile] xenia.livejournal.com
честно скажу, не знаю. но могу спросить :-)
microRNA - что-то такое

Re: =)))))))))))

Date: 2010-09-13 03:42 pm (UTC)
From: [identity profile] hejjhog.livejournal.com
Угу. Потому что микроРНК - это тоже очень очень обширная тема. И популярная до ужаса сейчас...

Date: 2010-09-13 07:23 am (UTC)
From: [identity profile] vlademen.livejournal.com
в каком штате?
живете с кошкой?)

Date: 2010-09-13 07:51 am (UTC)
From: [identity profile] lensovet.livejournal.com
http://lmgtfy.com/

Date: 2010-09-13 03:22 pm (UTC)
From: [identity profile] xenia.livejournal.com
Калифорния
да :-)

Profile

xenia: (Default)
xenia

February 2021

S M T W T F S
 12 34 56
78910111213
14151617181920
21222324252627
28      

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Apr. 13th, 2026 12:38 am
Powered by Dreamwidth Studios